210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0490 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 		 358 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  74.01 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5918  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  53.37 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  58.26 
 
 		 333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  63.14 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  58.56 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  56.85 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  58.67 
 
 		 263 aa  328  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  59.39 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  48.97 
 
 		 260 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  48.98 
 
 		 273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.17 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  42.52 
 
 		 252 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  47.44 
 
 		 285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  40 
 
 		 253 aa  203  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  35.35 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  35.35 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  39.39 
 
 		 257 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.33 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  40.6 
 
 		 249 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  38.05 
 
 		 250 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  39.46 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  37.71 
 
 		 250 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  37.8 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  38.19 
 
 		 257 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  39.93 
 
 		 271 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  38.13 
 
 		 262 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  39.86 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  38.62 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  38.33 
 
 		 264 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  38.33 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  39.86 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  38.28 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  38.57 
 
 		 267 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  38.7 
 
 		 252 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  38.57 
 
 		 267 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  37.67 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  39.45 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  40.34 
 
 		 267 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  39.86 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  34.88 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  36.01 
 
 		 267 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  37.05 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  37.11 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  37.11 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  37.63 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  37.11 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  37.11 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  37.33 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  35.54 
 
 		 248 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  37.11 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  39.1 
 
 		 272 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  37.54 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  38.51 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  35.92 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  34.8 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  36.77 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  38.75 
 
 		 270 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  34.47 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  37.37 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  36.27 
 
 		 287 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  33 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  34.8 
 
 		 264 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  38.49 
 
 		 271 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  35.95 
 
 		 276 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  37.02 
 
 		 266 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  37.33 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  38.64 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  35.96 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  36.08 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  36.43 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  37.67 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  36.43 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  37.38 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  35.74 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  35.88 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  35.74 
 
 		 269 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  42.01 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  35.27 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  38.74 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  38.64 
 
 		 268 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  38.93 
 
 		 227 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  38.18 
 
 		 266 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  37.15 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12600  predicted protein  38.43 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.78844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  35.52 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  36.64 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  38.59 
 
 		 257 aa  150  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  37.83 
 
 		 253 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  39.45 
 
 		 252 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  35.74 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  38.38 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  37.67 
 
 		 281 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  38.23 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  35.66 
 
 		 240 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  38.44 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  35.76 
 
 		 269 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  34 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  36.99 
 
 		 245 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  38.75 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>