158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1285 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1285  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
270 aa  550  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0727  carbohydrate oxidoreductase, putative  37.45 
 
 
302 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3512  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.18 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000550533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2247  carbohydrate oxidoreductase, putative  35.53 
 
 
304 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0790  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.67 
 
 
295 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.537712  hitchhiker  0.00444218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1263  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.27 
 
 
284 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.818753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2734  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.58 
 
 
301 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4585  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.56 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0747  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.36 
 
 
290 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3714  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.67 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.736415  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1870  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.87 
 
 
285 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.151369  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.19 
 
 
290 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4311  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5203  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.58 
 
 
345 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000290359  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.26 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.65 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1234  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.96 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0110  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.62 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.74 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.81 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.9 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.22 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.6 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0735  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.97 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.850791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.81 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.19 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.05 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.62 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.44 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.96 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0551  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.03 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2097  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.14 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.75 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1062  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.65 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.4 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.53 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.53 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.34 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.45 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.32 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.51 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1537  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.48 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.5 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.51 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3236  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.58 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1006  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.97 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.7 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.66 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.36 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.248818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0925  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.17 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.43 
 
 
306 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.12 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.38 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.28 
 
 
327 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2183  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.5 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2099  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.26 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.626697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.56 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.15 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0940  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.51 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.08 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4911  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.51 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1118  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.14 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000464599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.84 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1209  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.57 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4165  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.58 
 
 
296 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.09 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17350  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.01 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1299  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.14 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.9 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.9 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1276  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.92 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.2 
 
 
314 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.99 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.87 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0187  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.81 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.15 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00990  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.76 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4428  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.43 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1338  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.41 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1112  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.9 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0345479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.71 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.7 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.65 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.10972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1125  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.14 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.110653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4945  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.98 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.61 
 
 
285 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1376  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.93 
 
 
284 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580619  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1437  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.62 
 
 
363 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.57 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.17 
 
 
291 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0637  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.57 
 
 
306 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.618272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1741  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.48 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.6 
 
 
292 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>