154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0216 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  61.11 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  45.65 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 97 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  43.33 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  47.25 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  33.71 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  35.62 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  36.59 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  36.59 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  45.76 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  35.37 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  35.96 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 238 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  34.44 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  35.62 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  35.38 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  34.15 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  36.14 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  31.17 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  32.97 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  36.71 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  33.73 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  33.73 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  42.67 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  32.88 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 371 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  35.09 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  40.35 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  30.23 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  34.94 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>