More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1803 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  63.96 
 
 
641 aa  816    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  60.06 
 
 
647 aa  780    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  100 
 
 
649 aa  1325    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  58.76 
 
 
634 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  63.43 
 
 
632 aa  817    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  60.84 
 
 
634 aa  784    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  67.81 
 
 
639 aa  875    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
613 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  36.42 
 
 
612 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  35.74 
 
 
608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 
616 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 
566 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  35.9 
 
 
610 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  39.69 
 
 
582 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  40.42 
 
 
607 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  34.74 
 
 
609 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  38.92 
 
 
613 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.99 
 
 
602 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.08 
 
 
598 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.34 
 
 
598 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.73 
 
 
611 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  34.16 
 
 
611 aa  366  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.73 
 
 
611 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38 
 
 
585 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.56 
 
 
580 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  34.77 
 
 
611 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 
571 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  37.6 
 
 
588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.55 
 
 
556 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  38.51 
 
 
627 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.64 
 
 
611 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.9 
 
 
580 aa  353  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.78 
 
 
600 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.24 
 
 
572 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  38.25 
 
 
578 aa  350  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  40.2 
 
 
594 aa  351  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  38.57 
 
 
579 aa  349  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.96 
 
 
590 aa  349  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  38.06 
 
 
607 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.7 
 
 
583 aa  348  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.14 
 
 
581 aa  348  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1638  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.39 
 
 
604 aa  347  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  37.86 
 
 
589 aa  347  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.78 
 
 
577 aa  346  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
594 aa  345  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 
571 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.66 
 
 
600 aa  342  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  38.45 
 
 
603 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.66 
 
 
597 aa  342  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  32.5 
 
 
601 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  38.54 
 
 
618 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  36.17 
 
 
575 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0275  ABC transporter related protein  38.22 
 
 
651 aa  340  7e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
626 aa  339  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.23 
 
 
582 aa  339  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.06 
 
 
586 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.34 
 
 
601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.34 
 
 
601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.4 
 
 
582 aa  338  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.32 
 
 
583 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35 
 
 
582 aa  337  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.74 
 
 
582 aa  336  7e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.4 
 
 
602 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  37.67 
 
 
614 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.07 
 
 
579 aa  334  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.98 
 
 
582 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.98 
 
 
582 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.98 
 
 
582 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.98 
 
 
582 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.98 
 
 
582 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
601 aa  333  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.63 
 
 
582 aa  332  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  35.66 
 
 
599 aa  332  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.97 
 
 
617 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  33.08 
 
 
588 aa  329  7e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.22 
 
 
602 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  38.27 
 
 
600 aa  329  8e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.38 
 
 
600 aa  329  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.61 
 
 
607 aa  329  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  37.76 
 
 
676 aa  329  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.25 
 
 
635 aa  329  9e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  36.01 
 
 
578 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.41 
 
 
582 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.41 
 
 
582 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.41 
 
 
582 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.03 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.92 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.35 
 
 
586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.1 
 
 
600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  35.47 
 
 
584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.03 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.03 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
582 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
582 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
582 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
582 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.47 
 
 
583 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
582 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
582 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>