71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3018 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  909    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  34.25 
 
 		 325 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.45 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  30.47 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  26.56 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  28.81 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.75 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  27.82 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  24.62 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1166 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.9 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  23.85 
 
 		 272 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1160 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1170 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1160 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1160 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1170 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  26.32 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1199 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1160 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1160 aa  60.1  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  25.79 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  22.51 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  23.67 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.65 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  21.83 
 
 		 263 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  28.92 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  21.15 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.05 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  29.48 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  26.75 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  26.77 
 
 		 323 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1116 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  20.09 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  29.84 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.07 
 
 		 1048 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.75 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  28.16 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  27.59 
 
 		 243 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  21.99 
 
 		 442 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1282 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26 
 
 		 1656 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1183 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  28.28 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1242 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  22.26 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  22.98 
 
 		 538 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  22.98 
 
 		 538 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  26.39 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  26.5 
 
 		 480 aa  47  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  33.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  29.79 
 
 		 1611 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  27.31 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  21.96 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  24.62 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  27.55 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  23.25 
 
 		 838 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  22.48 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  26.77 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.41 
 
 		 1016 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.41 
 
 		 1016 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  22.78 
 
 		 516 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  26.46 
 
 		 541 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  23.05 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  23.4 
 
 		 511 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  23.4 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>