212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1059 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  40.14 
 
 		 268 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  40.74 
 
 		 268 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  36.69 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  40.74 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  38.1 
 
 		 274 aa  95.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  38.97 
 
 		 268 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  37.04 
 
 		 277 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  39.26 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  37.78 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  37.78 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  36.09 
 
 		 268 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  36.09 
 
 		 268 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  30.88 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  33.83 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  33.83 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  33.83 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  33.09 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  36.84 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  41.46 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.62 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  31.69 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.1 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2176  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.21 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  32.33 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.15 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  28.76 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.15 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  31.58 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.15 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  33.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  33.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  33.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  33.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  33.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  33.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  26.67 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  26.67 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  30.3 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.78 
 
 		 136 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.78 
 
 		 136 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.78 
 
 		 136 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  35.05 
 
 		 121 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  35.05 
 
 		 121 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  35.05 
 
 		 121 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  33.64 
 
 		 157 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  33.03 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  32.61 
 
 		 122 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  46 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  46 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5284  hypothetical protein  34.57 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.550113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  28.81 
 
 		 275 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  33.91 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  33.91 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  32.35 
 
 		 123 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  32.35 
 
 		 123 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  32.35 
 
 		 123 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  32.35 
 
 		 123 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  32.35 
 
 		 123 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_002978  WD0045  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0137  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0216  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0328  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.833285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0456  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.41925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0517  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0546  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.259245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0588  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0646  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0910  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0920  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0933  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1225  IS5 family transposase OrfA  29.81 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  33.33 
 
 		 122 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  33.33 
 
 		 122 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 		 139 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  29.79 
 
 		 126 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  40.38 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  25.66 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  34.18 
 
 		 117 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>