More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5284 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5284  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.550113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  40.95 
 
 
109 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  37.14 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  36.19 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  36.19 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  36.19 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  36.19 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  36.19 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  36.19 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  36.19 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  36.19 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  35.24 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  37.39 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  36.63 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  36.63 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  36.13 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  34.48 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0870  transposase  32.2 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  36.36 
 
 
134 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  35.65 
 
 
277 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  36.36 
 
 
134 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  36.36 
 
 
134 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  36.36 
 
 
134 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  36.36 
 
 
134 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  36.36 
 
 
134 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
147 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.94 
 
 
136 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.94 
 
 
136 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  37.5 
 
 
258 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  37.84 
 
 
276 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.94 
 
 
136 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  37.84 
 
 
276 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  38.27 
 
 
268 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  38.27 
 
 
268 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  35.45 
 
 
139 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  33.77 
 
 
272 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  32.17 
 
 
163 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  32.17 
 
 
163 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3240  transposase  35.24 
 
 
163 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  38.89 
 
 
123 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  38.89 
 
 
123 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  38.89 
 
 
123 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  38.89 
 
 
123 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  38.89 
 
 
123 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  33.93 
 
 
122 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3321  hypothetical protein  55.1 
 
 
71 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.763605  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.11 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6624  TIS1421-transposase protein A  32.41 
 
 
120 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.29117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  33.04 
 
 
122 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  33.04 
 
 
122 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.43 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  35.44 
 
 
119 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  35.44 
 
 
119 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  37.33 
 
 
127 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.32 
 
 
281 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  36.19 
 
 
268 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  33.03 
 
 
244 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.5 
 
 
251 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0667  hypothetical protein  29.27 
 
 
139 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  37.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  37.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  37.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  37.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  37.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  37.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  37.84 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  42.59 
 
 
104 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  42.59 
 
 
104 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  42.59 
 
 
104 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  36.23 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  36.23 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  29.27 
 
 
119 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  31.78 
 
 
126 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.31 
 
 
281 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.31 
 
 
281 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3088  hypothetical protein  30.38 
 
 
119 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0452769  normal  0.0619114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.31 
 
 
281 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1440  transposase  36.49 
 
 
129 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.624391 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  36.49 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  28.71 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  30.28 
 
 
141 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  39.74 
 
 
295 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  41.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>