More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0537 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 432 aa  880    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  51.25 
 
 		 447 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  52.78 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  52.76 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.28 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  52.13 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  53.77 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  51.81 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  52.3 
 
 		 448 aa  431  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  52.48 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  51.68 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.32 
 
 		 739 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  52.77 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.7 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.22 
 
 		 726 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  51.87 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 519 aa  418  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  49.06 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  50.79 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  51.31 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  51.2 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.36 
 
 		 721 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.06 
 
 		 735 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  49.41 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  51.8 
 
 		 463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  52.04 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  48.32 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.87 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.03 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  50.12 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.69 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.26 
 
 		 734 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  49.28 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  44.6 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  51.4 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  48.19 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  50.69 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  47 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.93 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  45.58 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  49.33 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  49.65 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  43.86 
 
 		 455 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  49.16 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  45.56 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  47.95 
 
 		 435 aa  378  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  44.87 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  46.48 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  46.4 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  51.52 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  46.19 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  41.9 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  49.01 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  45.64 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  41.9 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 445 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  44.89 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  41.63 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  44.89 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  45.13 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  50.96 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  45.3 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  45.19 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>