More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3024 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 337 aa  669    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.52 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.43 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  57.01 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.23 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.69 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  60.32 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.09 
 
 		 341 aa  358  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.33 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.69 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.94 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  56.21 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.62 
 
 		 337 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.66 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.69 
 
 		 338 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.05 
 
 		 337 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.4 
 
 		 351 aa  338  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.1 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.71 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.6 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.73 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.52 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  53.61 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  53.31 
 
 		 339 aa  325  9e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.55 
 
 		 339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  56.9 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  51.76 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.01 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.46 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.49 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.39 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.97 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.2 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.7 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.11 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  54.8 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.8 
 
 		 337 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.56 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.96 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.07 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.57 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.53 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  40.15 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  39.78 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  41.11 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.22 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  44.78 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  43.58 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.8 
 
 		 511 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  37.63 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  44.36 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  41.82 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  41.82 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  41.82 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  43.58 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  43.58 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.03 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  42.02 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  42.02 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  42.02 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  42.02 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  42.02 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  42.02 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  38.54 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  39.04 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  42.02 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.03 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  37.8 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  41.86 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  35.82 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  35.46 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  38.33 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  39.73 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  35.91 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  36.93 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  38.55 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.92 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.07 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  41.09 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.04 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  39.31 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  35.46 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.31 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.23 
 
 		 426 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  36.97 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  38.93 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  40.38 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  38.93 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  40.38 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>