More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2215 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  100 
 
 		 288 aa  570  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  47.84 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.65 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  48.01 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  48.75 
 
 		 287 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  44.29 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.48 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  44.21 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  44.21 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  43.57 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  43.93 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  40.14 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  46.62 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.88 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  46.98 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  41.84 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.07 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  38.85 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  47.16 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  41.22 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  42.09 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  41.45 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  41.45 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  41.45 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  41.45 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  41.45 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  41.45 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  42.09 
 
 		 285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  45.13 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  46.89 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  41.01 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  46.84 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  39.43 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  37.8 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  40.29 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  38.55 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  43.06 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  38.65 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  47.29 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  38.83 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  37.87 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  36.93 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  33.48 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  27.24 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  34.8 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.49 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.3 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.51 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.89 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  35.57 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.04 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  31.66 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.33 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  31.19 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.73 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.89 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.7 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.56 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.55 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>