42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0295 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  879    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  31.35 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  29.12 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  33.94 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  27.5 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  24.92 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  29.6 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  30.72 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  30.74 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  26.45 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  26.38 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  24.68 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  26.53 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  27.31 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  31.13 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  28 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  27.47 
 
 		 372 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  32.24 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  25.99 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  26.71 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  25.82 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  25.73 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  29.17 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  25.25 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  38.68 
 
 		 375 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  34.56 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  25.09 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  31.25 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  27.13 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  32.39 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  27.7 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  30.05 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  28.67 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  28.4 
 
 		 370 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  28.11 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  25.39 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  27.11 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  27.11 
 
 		 565 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  26.71 
 
 		 553 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  28.21 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  37.89 
 
 		 335 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>