33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3480 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  727    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  37.95 
 
 		 759 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  36.62 
 
 		 425 aa  152  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  36.79 
 
 		 404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  35.96 
 
 		 295 aa  126  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  35.31 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  29.46 
 
 		 453 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  32.48 
 
 		 466 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  37.84 
 
 		 518 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  45.38 
 
 		 161 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  27.48 
 
 		 451 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  34.5 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  34.75 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4582  hypothetical protein  24.24 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  29.03 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1783  hypothetical protein  24.12 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1691  hypothetical protein  30.26 
 
 		 241 aa  52.8  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  35.76 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  40.14 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1252  leucine rich repeat variant  29.06 
 
 		 320 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  34.78 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  32.2 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  32.2 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  43.9 
 
 		 126 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  34.23 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  37.86 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  33.92 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0767  hypothetical protein  34.83 
 
 		 137 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.383701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  34.42 
 
 		 255 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  34.42 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  32.8 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3599  leucine rich repeat variant  30.77 
 
 		 216 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  35.57 
 
 		 274 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>