14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5691 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  28.77 
 
 		 759 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  29.46 
 
 		 373 aa  99.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  30.67 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  31.09 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  30.04 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  26.59 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  31.72 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  34.06 
 
 		 160 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  25 
 
 		 662 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  35.58 
 
 		 161 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1783  hypothetical protein  21.83 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  28.21 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  31.36 
 
 		 276 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>