18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2649 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  316  7e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  41.04 
 
 		 759 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  37.21 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  36.36 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  34.75 
 
 		 373 aa  67.4  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  35.16 
 
 		 425 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  45.24 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  28.67 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  41.18 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  35.79 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  31.36 
 
 		 518 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 662 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  34.06 
 
 		 453 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  33.6 
 
 		 466 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1783  hypothetical protein  41.98 
 
 		 452 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0526  hypothetical protein  27 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  36.19 
 
 		 451 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4998  leucine-rich repeat-containing protein  37.18 
 
 		 146 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>