17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0919 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 466 aa  886    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  36.18 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  29.45 
 
 		 759 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  36.53 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  32.48 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  34.6 
 
 		 295 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  31.02 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  32.33 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  31.45 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  34.71 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  38.84 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  33.6 
 
 		 160 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  22.01 
 
 		 662 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1252  leucine rich repeat variant  27.35 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  30.64 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  33.58 
 
 		 263 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  33.58 
 
 		 263 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>