18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  40.69 
 
 		 425 aa  89  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  39.29 
 
 		 759 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  34.39 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  41.46 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  37.21 
 
 		 160 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  34.5 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  35.54 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  41.76 
 
 		 161 aa  62  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  34.71 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  29.33 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  32.26 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  32.41 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  31.36 
 
 		 453 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  31.4 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  33.07 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0767  hypothetical protein  36.11 
 
 		 137 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.383701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>