32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0869 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 463 aa  860    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  32.55 
 
 		 759 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  34.9 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  32.69 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  32.13 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  28.99 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  31.7 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  28.48 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  30.91 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  40.43 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  47.86 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  38.16 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  35.54 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  36.99 
 
 		 161 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  38.3 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  40.96 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  40.96 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  41.03 
 
 		 279 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  37.77 
 
 		 283 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  50.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  37.28 
 
 		 244 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4582  hypothetical protein  28.49 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0226  leucine-rich repeat-containing protein  39.13 
 
 		 157 aa  47  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  36.47 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  33.54 
 
 		 266 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  30.04 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  22.65 
 
 		 662 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  33.57 
 
 		 268 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 750 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  38.96 
 
 		 261 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  32.73 
 
 		 259 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>