16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5958 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 518 aa  1006    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  36.18 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  29.6 
 
 		 759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  37.84 
 
 		 373 aa  101  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  32.95 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 		 404 aa  91.3  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  34.5 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  35.29 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  27.23 
 
 		 662 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  37.88 
 
 		 161 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  28.21 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  31.36 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  38.06 
 
 		 255 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  31.1 
 
 		 244 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  37.16 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>