28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2116 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 255 aa  503  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  53.48 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  51.3 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  42.86 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  40.52 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  43.48 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  43.91 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  45.61 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  45.18 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  41.05 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  38.66 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  38.66 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  41.38 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  43.42 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  40.43 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  40.09 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  40 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  40.47 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  34.48 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  38.53 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  39.13 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  39.13 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  37.55 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  34.06 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  39.89 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  36.92 
 
 		 425 aa  49.3  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  37.42 
 
 		 518 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>