27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  830    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  37.66 
 
 		 759 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  36.62 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  35.45 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  32.13 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  30.35 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  34.3 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  30.67 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  31.06 
 
 		 518 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  40.69 
 
 		 276 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  41.03 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  35.29 
 
 		 160 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  24.1 
 
 		 662 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  33.89 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  34.97 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4582  hypothetical protein  26.2 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  40.5 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  41.86 
 
 		 126 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  36.63 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  33.66 
 
 		 255 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.85 
 
 		 1328 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4998  leucine-rich repeat-containing protein  31.75 
 
 		 146 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  34.9 
 
 		 244 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0767  hypothetical protein  35.63 
 
 		 137 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.383701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  39.36 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  31.35 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0250  hypothetical protein  30.22 
 
 		 208 aa  43.5  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>