30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1449 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  72 
 
 		 279 aa  351  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  60.61 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  54.85 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  51.25 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  51.46 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  48.43 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  48.43 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  52.3 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  50.21 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  51.04 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  51.04 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.41 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  44.53 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  50.84 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  47.68 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  46.84 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  44.26 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  43.48 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  40.86 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  43.7 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  36.92 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  46.44 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  41.8 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  42.71 
 
 		 211 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  36.63 
 
 		 425 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  40.14 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  33.99 
 
 		 759 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  34.29 
 
 		 463 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  33.07 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>