27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0996 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 274 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  49.01 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.9 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  43.97 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  47.66 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  42.52 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  49.59 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  47.62 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  42.8 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  42.8 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  45.56 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.54 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  47.28 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.28 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  45.61 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  44.66 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  45.11 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  44.53 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  43.67 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.22 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  46.59 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  40 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  41.2 
 
 		 244 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  43.46 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  38.36 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1343 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  35.57 
 
 		 373 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>