30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5900 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  68.18 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  56.57 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  59.43 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  57.59 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  59.43 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  58.78 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  50.4 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  52.07 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  52.07 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  50.21 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  51.03 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.1 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  45.56 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  48.33 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  49.37 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  49.37 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.95 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  39.59 
 
 		 268 aa  178  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  49.37 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  44.26 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  40.43 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  46.19 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  41.48 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  36.17 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  32.8 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.73 
 
 		 1343 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  34.13 
 
 		 759 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  39.36 
 
 		 425 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  30.3 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>