27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1408 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  534  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  60.61 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  57.79 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  52.92 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  50.63 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  48.35 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  48.35 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  48.41 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  50.43 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  48.1 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  47.46 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  49.79 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  48.1 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  44.66 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.48 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.06 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  47.06 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  38.46 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  46.75 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  43.8 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  43.91 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  42.75 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  45.83 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  44.84 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  42.63 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  34.71 
 
 		 759 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  36.5 
 
 		 463 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>