28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0208 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  52.4 
 
 		 266 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  54.07 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  51.22 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  50.56 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  50.56 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  54.07 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  55.74 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  50.4 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  52.09 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  51.46 
 
 		 278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  48.55 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  47.62 
 
 		 274 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.46 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  44.62 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  45.9 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  45.9 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  41.53 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.96 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  44.8 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  42.86 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  41.53 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  41.7 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  45.05 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  42.51 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  32.67 
 
 		 463 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  34.23 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  28.97 
 
 		 759 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>