39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4105 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  100 
 
 		 759 aa  1524    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  37.95 
 
 		 373 aa  181  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  39.58 
 
 		 425 aa  178  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  39.56 
 
 		 295 aa  144  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  29.36 
 
 		 404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  32.55 
 
 		 463 aa  132  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  29.91 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  28.77 
 
 		 453 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  30.71 
 
 		 518 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  39.29 
 
 		 276 aa  86.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  41.04 
 
 		 160 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.85 
 
 		 2194 aa  84.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  45.08 
 
 		 161 aa  80.5  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  32.56 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  48.28 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  30.2 
 
 		 662 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  29.53 
 
 		 1328 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4582  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  42.7 
 
 		 126 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.23 
 
 		 1742 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1783  hypothetical protein  26.42 
 
 		 452 aa  56.6  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0250  hypothetical protein  31.67 
 
 		 208 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4106  GUN4-like protein  41.1 
 
 		 215 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 		 1102 aa  52.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.220309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  33.15 
 
 		 244 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  50.63 
 
 		 358 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.28 
 
 		 1237 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2446  GUN4 domain protein  35.71 
 
 		 250 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.786071  hitchhiker  0.0000000955131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1691  hypothetical protein  32.53 
 
 		 241 aa  50.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  37.09 
 
 		 279 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.89 
 
 		 1349 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  34.71 
 
 		 270 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  33.99 
 
 		 278 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4998  leucine-rich repeat-containing protein  35 
 
 		 146 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  28.97 
 
 		 263 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  37.31 
 
 		 255 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  24.38 
 
 		 1345 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3856  hypothetical protein  29.06 
 
 		 174 aa  44.3  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.28 
 
 		 1474 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>