17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0150 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  39.56 
 
 		 759 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  35.96 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  35.45 
 
 		 425 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  33.94 
 
 		 404 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  30.07 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  33.9 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  41.46 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  27.97 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  40.98 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  31.2 
 
 		 662 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  30.04 
 
 		 453 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  33.62 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  45.68 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0250  hypothetical protein  28.25 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  28.09 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>