15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1258 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1258  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 404 aa  803    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  29.36 
 
 		 759 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  36.79 
 
 		 373 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  29.79 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0150  leucine-rich repeat-containing protein  31.49 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.413974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0919  leucine-rich repeat-containing protein  31.02 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  31.54 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18830  hypothetical protein  34.39 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.094328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  29.11 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5691  hypothetical protein  26.59 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2649  hypothetical protein  35.79 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66893  normal  0.983089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0525  hypothetical protein  26.92 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1547  hypothetical protein  39.47 
 
 		 126 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748357 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05910  hypothetical protein  35.78 
 
 		 161 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3484  leucine-rich repeat-containing protein  29.95 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000424211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>