31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  100 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  52.36 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  53.48 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  41.7 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  43.7 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  41.63 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  44.72 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  44.84 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  42.11 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  40.87 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  40.87 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  40.52 
 
 		 265 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  39.91 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  42.49 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  41.48 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  41.38 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  40.52 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  41.2 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  39.46 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  33.91 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  38.84 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  39.73 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  40.87 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  39.9 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  35.36 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1343 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  33.15 
 
 		 759 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  31.33 
 
 		 463 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03780  hypothetical protein  34.9 
 
 		 425 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.972704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  35.04 
 
 		 373 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5958  leucine-rich repeat-containing protein  29.86 
 
 		 518 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>