27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3642 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  100 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  56.33 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  52.67 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  52.67 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  58.4 
 
 		 259 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  58.78 
 
 		 257 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  58.61 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  54.04 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  51.96 
 
 		 265 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  52.09 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  52.3 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  48.12 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  48.58 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.77 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.18 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.1 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  45.85 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.11 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  36.86 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  46.67 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  41.38 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  42.49 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  40 
 
 		 252 aa  142  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  42.19 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  45.41 
 
 		 211 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  39.13 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 		 1343 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>