27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0400 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  58.94 
 
 		 259 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  56.57 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  55.43 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  56.56 
 
 		 268 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  56.75 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  56.33 
 
 		 283 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  51.01 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  51.01 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  52.4 
 
 		 263 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  52.92 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  54.85 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  49.2 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  49.79 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  41.5 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  47.9 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.54 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  47.54 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  45.34 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  49.38 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  40.32 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  40.93 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  46.15 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  41.63 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  41.05 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  36.88 
 
 		 463 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.06 
 
 		 1343 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>