More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0602 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  84.02 
 
 
526 aa  871    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  86.72 
 
 
525 aa  902    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
545 aa  1110    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  58.99 
 
 
528 aa  599  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  47.61 
 
 
501 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  46.99 
 
 
501 aa  435  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  43.54 
 
 
499 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  44.24 
 
 
529 aa  392  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 
501 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  33.78 
 
 
544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  35.1 
 
 
543 aa  274  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  32.83 
 
 
551 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  32.64 
 
 
551 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
544 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.19 
 
 
551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 
550 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  31.42 
 
 
551 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
539 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  31.9 
 
 
533 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
551 aa  233  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
543 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.88 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  32.06 
 
 
541 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
521 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
523 aa  193  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 
534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.48 
 
 
535 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 
516 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.6 
 
 
516 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.54 
 
 
516 aa  188  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
516 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.4 
 
 
516 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.4 
 
 
516 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 
508 aa  186  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.54 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
544 aa  184  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.14 
 
 
531 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 
528 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
535 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.19 
 
 
541 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
506 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.72 
 
 
535 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  28.72 
 
 
535 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  28.72 
 
 
535 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  28.14 
 
 
535 aa  176  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  28.14 
 
 
535 aa  176  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  28.14 
 
 
535 aa  176  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  28.14 
 
 
535 aa  176  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.14 
 
 
535 aa  176  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.14 
 
 
535 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.04 
 
 
520 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 
535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.93 
 
 
535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.67 
 
 
544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.93 
 
 
535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 
556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
535 aa  174  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
525 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.09 
 
 
526 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.09 
 
 
526 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.09 
 
 
526 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.1 
 
 
524 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.03 
 
 
505 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
531 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.09 
 
 
526 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.87 
 
 
526 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
535 aa  171  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
546 aa  170  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.82 
 
 
520 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 
531 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 
566 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 
531 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 
535 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
547 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 
610 aa  166  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
541 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 
547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.45 
 
 
510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
589 aa  163  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.1 
 
 
521 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 
590 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
521 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.1 
 
 
521 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.1 
 
 
521 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.1 
 
 
521 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
529 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 
531 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
508 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  26.77 
 
 
526 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.05 
 
 
550 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
530 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>