More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3352 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  100 
 
 		 158 aa  319  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  61.69 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  61.84 
 
 		 159 aa  191  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 157 aa  190  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  58.17 
 
 		 172 aa  186  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 153 aa  186  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  59.48 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  58.17 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  59.48 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  57.79 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  59.48 
 
 		 159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 169 aa  179  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 162 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  49.34 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  51.97 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 162 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  48.03 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  48.03 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  48.03 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  48.03 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  48.03 
 
 		 229 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  48.03 
 
 		 229 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44.94 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44.94 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  47.37 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.75 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 213 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  45.39 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  47.95 
 
 		 167 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  47.95 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  47.95 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  47.95 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>