31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3105 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  100 
 
 		 535 aa  1111    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  29.4 
 
 		 477 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  22.05 
 
 		 636 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  26.62 
 
 		 582 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  23.88 
 
 		 628 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  22.12 
 
 		 625 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  23.21 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  27.23 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  22.28 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  29.03 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  26.49 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  28.76 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  25.32 
 
 		 515 aa  53.9  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  26.14 
 
 		 316 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  23.76 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  27.74 
 
 		 630 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  28.57 
 
 		 280 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  27.92 
 
 		 610 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  26.62 
 
 		 609 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  26.62 
 
 		 609 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  26.35 
 
 		 563 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  23.12 
 
 		 563 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  25.97 
 
 		 616 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  22.3 
 
 		 617 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  25.49 
 
 		 514 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  26.49 
 
 		 609 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  25.49 
 
 		 532 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  23.78 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  24.5 
 
 		 591 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  23.04 
 
 		 569 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  20.48 
 
 		 523 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>