More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0413 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0413  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.739414  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1062  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.38 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790133  normal  0.732766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4556  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.972844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0154  amino acid ABC transporter permease  37.25 
 
 
221 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  31.37 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  31.37 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  31.37 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  31.37 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.35 
 
 
219 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  31.37 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  31.37 
 
 
219 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  31.37 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1687  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.73 
 
 
248 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763978  normal  0.68129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0305  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
221 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  34.2 
 
 
223 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1149  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.19 
 
 
240 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0315  putative ABC transporter permease protein  34.39 
 
 
213 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000179875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  30.39 
 
 
219 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.73 
 
 
220 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  hitchhiker  0.00891896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4963  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.17 
 
 
248 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0584906  normal  0.053215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.43 
 
 
219 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5460  amino acid ABC transporter permease  31.5 
 
 
226 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
221 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1917  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
221 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.18588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.58 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646385  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3744  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.03 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  31.63 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00418  ABC-type amino acid transport system permease component  31.25 
 
 
246 aa  98.6  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0297  amino acid ABC transporter permease  30.39 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4842  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 
220 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.131186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.75 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6714  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  29.32 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1821  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377304  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0330968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5965  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  32.97 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2074  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.22 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3671  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.2 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.34 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3013  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1834  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.16 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.448047  normal  0.895593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  30.37 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3248  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.91 
 
 
248 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350579  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5246  amino acid ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 
228 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  32.16 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.98 
 
 
323 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  32.16 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
485 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5510  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.37 
 
 
324 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.442153  decreased coverage  0.000455607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.3 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
485 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  30.26 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0724  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.24 
 
 
241 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670046  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2970  amino acid ABC transporter permease  32.47 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0576  ABC-type amino acid transport system, permease component  28.57 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.307016  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3263  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.86 
 
 
323 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1987  amino acid ABC transporter permease  32.03 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45101  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 
217 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90786  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.59 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3381  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.23 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.782136  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0905  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.41 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2431  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  30.69 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.460682  normal  0.0698059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1552  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.77 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  30.21 
 
 
485 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  32.97 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.03 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.27 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.24 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.56 
 
 
510 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1072  amino acid ABC transporter permease  33.77 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0718  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_004310  BR1955  amino acid ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4694  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  33.56 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586539  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.9 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.42 
 
 
492 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1680  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.18 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0758513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1881  amino acid ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9239  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  30.27 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1528  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.56 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.81 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4635  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 
222 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1516  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  30.35 
 
 
223 aa  89  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219421  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.56 
 
 
219 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.26 
 
 
230 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1186  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.78 
 
 
222 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04080  putative permease of ABC transporter  30.26 
 
 
230 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3382  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.45 
 
 
217 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281722  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0358  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.69 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0968449  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>