More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0154 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0154  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4556  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.972844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1062  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.76 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790133  normal  0.732766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0413  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  37.25 
 
 
217 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.739414  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
221 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  36.26 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0221902 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6678  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
241 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1955  amino acid ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
240 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5965  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  38.37 
 
 
222 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226556  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4635  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.14 
 
 
222 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  31.51 
 
 
225 aa  104  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1881  amino acid ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 
232 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1821  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.31 
 
 
220 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377304  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4842  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.31 
 
 
220 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.131186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1834  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.08 
 
 
225 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.448047  normal  0.895593 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.23 
 
 
221 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
225 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.69 
 
 
227 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1149  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
240 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  30.14 
 
 
225 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3381  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
218 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.782136  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0998  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  32.45 
 
 
250 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0474623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0927  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  32.45 
 
 
250 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0060542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  31.79 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0233  amino acid ABC transporter permease  32.47 
 
 
217 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  30.81 
 
 
225 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4372  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter permease EhuD  30.19 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3748  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.19 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
214 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0718  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 
220 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0894  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  31.91 
 
 
250 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.305674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  28.44 
 
 
232 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3976  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 
234 aa  98.6  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.66874  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0531  ABC-type amino acid transport system, permease component  31.22 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0677  amino acid ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 
218 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.9 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  31.79 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  31.79 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0908  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.258464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.44 
 
 
232 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00418  ABC-type amino acid transport system permease component  30.58 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  34.52 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  31.79 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0975784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1148  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.77 
 
 
290 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312704  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  26.34 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  26.34 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  26.34 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  26.34 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.03 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3312  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.65 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.89 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.79 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.54 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1987  amino acid ABC transporter permease  35.03 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45101  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  hitchhiker  0.00891896 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5510  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 
324 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.442153  decreased coverage  0.000455607 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5238  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuD  31.31 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.86624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0283  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  31.75 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.416279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4426  amino acid ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000584538 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6714  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  32.47 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  27.83 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2850  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5517  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuD  30.81 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 
234 aa  95.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0770  amino acid ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0183  amino acid ABC transporter permease  34.87 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.31 
 
 
221 aa  95.1  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3744  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
214 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  29.06 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0933  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118003  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646385  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3468  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.15 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  29.13 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  29.13 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0878  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
221 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105888  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  29.13 
 
 
218 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0214  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.08 
 
 
516 aa  93.6  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.002492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.52 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5810  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709635  normal  0.465789 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3697  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter permease protein EhuD  31.31 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04080  putative permease of ABC transporter  34.21 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  34.21 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>