More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3671 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3671  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  87.89 
 
 
223 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3748  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.63 
 
 
222 aa  268  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3335  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.09 
 
 
223 aa  254  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5079  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.92 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0506194  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3419  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.85 
 
 
223 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.25 
 
 
223 aa  225  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670046  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2074  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.02 
 
 
227 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3461  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.9 
 
 
222 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5459  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  48.2 
 
 
222 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0174  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.2 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1687  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  51.71 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763978  normal  0.68129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3668  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.44 
 
 
218 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5949  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.2 
 
 
222 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426102  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1708  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.36 
 
 
227 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4963  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.73 
 
 
248 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0584906  normal  0.053215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1492  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.3 
 
 
223 aa  208  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 
227 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7089  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.3 
 
 
222 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107258  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3473  amino acid ABC transporter permease  49.26 
 
 
220 aa  204  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2439  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
234 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1032  amino acid ABC transporter permease  50.98 
 
 
227 aa  198  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000922275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3210  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2074  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.34 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6714  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  48.78 
 
 
254 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0908  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 
222 aa  194  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.258464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1917  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.78 
 
 
221 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.18588 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5266  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.66 
 
 
223 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5542  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 
223 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.645563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0878  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 
221 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105888  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3248  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 
248 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350579  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3312  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 
221 aa  191  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3468  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.27 
 
 
222 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.29 
 
 
222 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5246  amino acid ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
221 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3976  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.25 
 
 
234 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.66874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5460  amino acid ABC transporter permease  45.74 
 
 
226 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0297  amino acid ABC transporter permease  45.21 
 
 
221 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4924  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.05 
 
 
251 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.69133  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0933  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.78 
 
 
221 aa  184  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118003  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0229  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 
242 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0210  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.25 
 
 
228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6997  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 
228 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0515813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1497  amino acid ABC transporter permease  46.46 
 
 
228 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6332  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 
228 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4064  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.02 
 
 
218 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160055  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4512  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.95 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0162  amino acid ABC transporter permease  50.99 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2104  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  49.23 
 
 
248 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1601  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.59 
 
 
227 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0305  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.15 
 
 
221 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1512  ABC transporter membrane spanning protein  47.09 
 
 
223 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3448  amino acid ABC transporter permease  47.09 
 
 
222 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3328  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 
222 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3189  amino acid ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 
222 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3975  amino acid ABC transporter permease  45.67 
 
 
233 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1502  amino acid ABC transporter permease  50 
 
 
220 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0018  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.21 
 
 
244 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0013  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.72 
 
 
244 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.38894  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2431  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  44.8 
 
 
222 aa  167  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.460682  normal  0.0698059 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4670  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0448  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.59 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0692  amino acid ABC transporter permease  39.27 
 
 
222 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194775  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
216 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6678  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.92 
 
 
241 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.79 
 
 
216 aa  148  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 
492 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
216 aa  144  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.55 
 
 
216 aa  143  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.55 
 
 
216 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 
227 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6210  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.69 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6379  amino acid ABC transporter permease  37.69 
 
 
222 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6612  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.69 
 
 
222 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0311568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 
223 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
250 aa  138  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 
226 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.08 
 
 
493 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1026  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
221 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  39.36 
 
 
216 aa  135  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1655  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.37 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0134455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1927  amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  36.79 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  36.79 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  34.11 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  36.79 
 
 
226 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  36.79 
 
 
232 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
232 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
251 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  39.06 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3109  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>