More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5659 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  40.55 
 
 		 298 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  39.91 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  40.45 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  41.86 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  41.4 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 280 aa  148  7e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  41.71 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  40.65 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  40.65 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  40.65 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  38.46 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  39.42 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  35.98 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  37.96 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  34.23 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  38.21 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  39.35 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.38 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  38.94 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  45 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  39.71 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  37.56 
 
 		 256 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  37.84 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  36.28 
 
 		 252 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  35.05 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  37.56 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  33.49 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  39.32 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  33.64 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  36 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  33.94 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  29.52 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  32.63 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  32.63 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  37.73 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  30.94 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  38.32 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  35.55 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  35.55 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  31.02 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  34.33 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  37.13 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  31.66 
 
 		 265 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  39.33 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  33.33 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  31.66 
 
 		 265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  35.62 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  27.78 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3920  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  32.16 
 
 		 311 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  31.8 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  33.62 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  28.96 
 
 		 288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  37.91 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  34.93 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  32.04 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  31.98 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  32.16 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 238 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  28.44 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  31.22 
 
 		 275 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  36.06 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  33.33 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.13 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  31.47 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  31.98 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  31.98 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  31.98 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  31.55 
 
 		 296 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  34.26 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  33 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  27.52 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  33.33 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  27.52 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  26.61 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  30.73 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  30.81 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  30.48 
 
 		 289 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  28.23 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  36.5 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  27.62 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  30.24 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  29.58 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>