More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3678 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3678  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 468 aa  949    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  34.74 
 
 		 693 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  35.73 
 
 		 680 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 741 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  35.22 
 
 		 680 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  35.51 
 
 		 680 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 		 680 aa  250  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  33.76 
 
 		 808 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  33.76 
 
 		 688 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  34.74 
 
 		 671 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  32.92 
 
 		 702 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  33.85 
 
 		 680 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 968 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  34.95 
 
 		 790 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  33.63 
 
 		 675 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  32.26 
 
 		 763 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  33.77 
 
 		 678 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3029  Rhs element Vgr protein  34.6 
 
 		 540 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 		 684 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  30.9 
 
 		 694 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  33.26 
 
 		 689 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  29.66 
 
 		 675 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 691 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 1118 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  26.11 
 
 		 709 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  29.44 
 
 		 740 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  30.36 
 
 		 706 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  29.87 
 
 		 740 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  29.21 
 
 		 732 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  29.4 
 
 		 741 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  29.4 
 
 		 741 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  27.54 
 
 		 683 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0628  Rhs element Vgr protein  31.32 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  29.17 
 
 		 725 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  28.46 
 
 		 668 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  28.53 
 
 		 668 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  27.54 
 
 		 683 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  30.22 
 
 		 669 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  25.11 
 
 		 618 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  27.07 
 
 		 668 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  29.11 
 
 		 697 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  27.58 
 
 		 699 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 694 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  27.75 
 
 		 1095 aa  150  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  26.85 
 
 		 655 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 703 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 875 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  25.44 
 
 		 682 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  26.97 
 
 		 694 aa  146  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 		 869 aa  146  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  27.49 
 
 		 871 aa  146  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 731 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  27 
 
 		 692 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  27.16 
 
 		 754 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  27.75 
 
 		 780 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 757 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  27.56 
 
 		 609 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 		 642 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 763 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  27.33 
 
 		 617 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  27.07 
 
 		 1017 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  27.22 
 
 		 771 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  26.4 
 
 		 641 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 763 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  25.21 
 
 		 753 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  27.69 
 
 		 619 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 661 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  26.35 
 
 		 692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 748 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 748 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 763 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 748 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 748 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  24.72 
 
 		 618 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  27.21 
 
 		 615 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  27.13 
 
 		 661 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 661 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 661 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 661 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 661 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 661 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  27.21 
 
 		 616 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 661 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  27.13 
 
 		 610 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 734 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  26.65 
 
 		 617 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  28.06 
 
 		 763 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  25.73 
 
 		 754 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  25.84 
 
 		 656 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  26.65 
 
 		 617 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  25.65 
 
 		 678 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  26.65 
 
 		 617 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>