More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1341 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  87.65 
 
 		 260 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  87.65 
 
 		 260 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  81.1 
 
 		 289 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  77.55 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  77.14 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  71.26 
 
 		 257 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  69.17 
 
 		 246 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  61.35 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  65.53 
 
 		 267 aa  325  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  62.3 
 
 		 263 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  61.51 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.27 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  58.02 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  59.11 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  60.49 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  59.84 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  59.43 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  59.26 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  63.37 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  58.72 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  58.4 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  51 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  44.26 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 364 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  46.3 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 384 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  39.53 
 
 		 245 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 		 361 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  42.53 
 
 		 384 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.26 
 
 		 315 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  39 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.5 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  45.13 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  44.44 
 
 		 358 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  43.93 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  43.13 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.54 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  46.15 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  43.18 
 
 		 382 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  43.93 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.08 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  40.83 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  42.73 
 
 		 382 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  42.98 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.24 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  38.67 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  38.98 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  42.59 
 
 		 387 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.34 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  41.82 
 
 		 382 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  43.06 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  42.2 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  41.15 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 304 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  38.99 
 
 		 339 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 384 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  38.04 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.41 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.45 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.96 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  42.99 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.45 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  37.78 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.64 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.785325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.08 
 
 		 364 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3789  ABC transporter related  44.64 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.860108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.41 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  42.72 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 354 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  45.12 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 369 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.49 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 331 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.08 
 
 		 364 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  45.45 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 331 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43 
 
 		 289 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.66 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  43.36 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 384 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  39.76 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  40.5 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  43.72 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3728  ABC transporter related  43.51 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  40.83 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>