More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1364 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  80.78 
 
 		 262 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  81.89 
 
 		 260 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  80.66 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  77.96 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  72.9 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  69.92 
 
 		 257 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  69.14 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  63.89 
 
 		 267 aa  328  7e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  62.76 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  61 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  60.94 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  59.75 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.75 
 
 		 279 aa  292  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  58.9 
 
 		 276 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  60.24 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  59.91 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  58.85 
 
 		 263 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  58.37 
 
 		 263 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  56.1 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  57.61 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  53.75 
 
 		 274 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  48.45 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  41.39 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  40.17 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.89 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.73 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.21 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.75 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  45.79 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  46.26 
 
 		 382 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 		 382 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 		 364 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  45.33 
 
 		 259 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.81 
 
 		 382 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.2 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  45.79 
 
 		 382 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.2 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  39.92 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  43.59 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 364 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 364 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.2 
 
 		 364 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  41.01 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  39.09 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  44.13 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  39.92 
 
 		 276 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  36.9 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  43.39 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.32 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  43.93 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 		 380 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  40.74 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 		 366 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 351 aa  169  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.66 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.3 
 
 		 382 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.06 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  46.05 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  41.47 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  46.41 
 
 		 384 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  40.55 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.95 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.13 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.78 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  42.48 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  42.99 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 354 aa  168  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 		 348 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.27 
 
 		 359 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 388 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 384 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  39.42 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.4 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.5 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 329 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 327 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  37.65 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>