47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0740 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1340    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  49.24 
 
 		 660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  29.86 
 
 		 664 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  28.14 
 
 		 658 aa  210  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  27.72 
 
 		 661 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  28.49 
 
 		 661 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  28.32 
 
 		 668 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  27.71 
 
 		 662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  28.51 
 
 		 666 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  28.16 
 
 		 660 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  25.37 
 
 		 663 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  23.45 
 
 		 676 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  25.39 
 
 		 677 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  40.24 
 
 		 671 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  29.09 
 
 		 436 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  29.31 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  23.4 
 
 		 663 aa  95.5  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  27.97 
 
 		 671 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  32.67 
 
 		 683 aa  77  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  20.06 
 
 		 642 aa  76.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  23.74 
 
 		 657 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  27.76 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  38.82 
 
 		 354 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  24.31 
 
 		 672 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  31.33 
 
 		 395 aa  48.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  36.36 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  24.32 
 
 		 693 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  24.32 
 
 		 693 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  28.32 
 
 		 986 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  25.51 
 
 		 690 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1018 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  31.58 
 
 		 1047 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  35.19 
 
 		 1018 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1018 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1018 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  36.73 
 
 		 1018 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  35.19 
 
 		 1018 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  38.78 
 
 		 1018 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  38 
 
 		 1020 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  34.69 
 
 		 1018 aa  45.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  35.19 
 
 		 1020 aa  44.3  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  33.33 
 
 		 1046 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  20.93 
 
 		 427 aa  43.9  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  31.25 
 
 		 890 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>