More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2507 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 335 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  94.31 
 
 		 335 aa  654    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  56.19 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  54.82 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  53.17 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  51.39 
 
 		 359 aa  348  8e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  50.6 
 
 		 362 aa  347  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  49.54 
 
 		 391 aa  338  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  47.13 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  46.11 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  45.48 
 
 		 391 aa  307  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  46.61 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  45.99 
 
 		 336 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  46.59 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  47.45 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  44.24 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  43.71 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  40.18 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.72 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  24.59 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  24.59 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  26.58 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  30.57 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  30.57 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  30.57 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  21.8 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.19 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.18 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  23.17 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  23.11 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  23.53 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.81 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.31 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  23.53 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  22.68 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.75 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  27.49 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  24.22 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  26.71 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.09 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  28.4 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  28.5 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.62 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  25.93 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  22.66 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  26.72 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  22.16 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  28.33 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  26.04 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  23.05 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  28.95 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.7 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  26.27 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  32.7 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  24.9 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  23.16 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>