63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2085 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  621  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  82.56 
 
 		 295 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  80.78 
 
 		 295 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  73.68 
 
 		 290 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  62.36 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  63.33 
 
 		 289 aa  355  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  50.36 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  50.36 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  47.9 
 
 		 301 aa  299  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  46.72 
 
 		 285 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  48.18 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  46.72 
 
 		 287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  46.72 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  43.21 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  43.27 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  42.91 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  42.91 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  38.91 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  38.11 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  34.98 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  36.69 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  39.52 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  36.69 
 
 		 289 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  35.84 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  32.86 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  34.3 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  30.63 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  35.17 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  32.33 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  32.85 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  34.07 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  31.43 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  32.61 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  31.43 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  32 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  31.79 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  33.57 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  33.68 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  33.09 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  33.59 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  31.46 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  29.39 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  30.68 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  33.2 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  31.39 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  32.56 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  31.35 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  30.59 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  29.53 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  32.82 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  30.04 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  29.06 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  29.13 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  29.26 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  26.36 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  35.06 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  23.17 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_30  hypothetical protein  37.31 
 
 		 96 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>