More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1856 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  72.5 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  68.64 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  66.94 
 
 		 123 aa  167  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  69.17 
 
 		 127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  68.33 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  62.18 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  61.02 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  59.32 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  56.78 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  53.72 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  45.83 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  46.09 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  47.46 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.3 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  39.64 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  40.52 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  39.5 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  44.63 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  35.25 
 
 		 116 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  44.25 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  40.34 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  44.63 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  44.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  44.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  44.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  42.86 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  44.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  38.98 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  44.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  44.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 114 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  44.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  42.98 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  46.61 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  39.09 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  40 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  36.97 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  39.09 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  36.21 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  36.97 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  36.97 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  36.97 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  38.74 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  40.52 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  41.38 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  41.38 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  41.38 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  41.38 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  38.05 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  42.98 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  41.38 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  40.37 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  37.29 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>