More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1404 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  887    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  52.91 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  52.72 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  51.41 
 
 		 525 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  55.63 
 
 		 648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  56.1 
 
 		 784 aa  242  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  53.7 
 
 		 799 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  49.38 
 
 		 343 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  36.72 
 
 		 375 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  49.38 
 
 		 343 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  43.17 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  44.4 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  44 
 
 		 343 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  48.66 
 
 		 343 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  41.31 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  36.64 
 
 		 374 aa  209  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  47.56 
 
 		 341 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  55.13 
 
 		 314 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  45.23 
 
 		 341 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  34.42 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  46.93 
 
 		 342 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  39.51 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  42.21 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 337 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  44.89 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  44.08 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  40.73 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  43.46 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  44.81 
 
 		 341 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  41.5 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  38.51 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  38.02 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  40.42 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  33.96 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  34.5 
 
 		 287 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  34.02 
 
 		 291 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  47.01 
 
 		 272 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 		 277 aa  94  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 266 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  41.32 
 
 		 292 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 		 248 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 307 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  39.71 
 
 		 323 aa  86.7  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 245 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  34.46 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  42.62 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  32.65 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  32.28 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  35.98 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  35.54 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 		 275 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  41.8 
 
 		 275 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  38.69 
 
 		 283 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  30.07 
 
 		 225 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  39.66 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  30.07 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  29.79 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  34.36 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  39.66 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.11 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  37.69 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  36.52 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  38.1 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  34.36 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  29.84 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  30.07 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  30.07 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  30.07 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  30.07 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  30.07 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  32.56 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  34.4 
 
 		 179 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  29.37 
 
 		 225 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  29.37 
 
 		 225 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.96 
 
 		 281 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>