More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2900 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1030  TatD-related deoxyribonuclease  28.86 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2029  TatD-related deoxyribonuclease  28.51 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.755342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  31.6 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  25.61 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3158  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5067  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0939  TatD-related deoxyribonuclease  27.71 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  29.75 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  28.43 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  30.74 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6142  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1469  TatD-related deoxyribonuclease  25.3 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170381  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  28.11 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  30.92 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  26.48 
 
 		 266 aa  88.6  8e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  29.7 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  25.79 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  24.9 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  28.74 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  28.74 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  29.8 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  29.8 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  25.3 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  29.23 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  29.12 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  23.17 
 
 		 265 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  25.51 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0664  TatD-related deoxyribonuclease  29.15 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  24.19 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  29.02 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  24.9 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  27.27 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5210  TatD-related deoxyribonuclease  28.45 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  24.6 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  24.6 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  25.4 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  27.41 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  29.73 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  26.64 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  28.36 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  24.19 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  24.19 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  26.95 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  26.46 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  26.15 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  35.4 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  27.97 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  28.35 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  27.97 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  25.97 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  25.98 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  26.59 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  24.5 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  25.78 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  29.61 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  26.07 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  26.07 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  26.07 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4247  TatD-related deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.555643  decreased coverage  0.000153731 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  23.39 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  25.38 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  27.52 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  28.96 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  25.68 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  25.68 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  25.68 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  26.07 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  25.68 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  24.7 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  27.69 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  26.21 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  27.63 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  25.68 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  23.74 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  24.8 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  26.67 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  28.83 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  25.39 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  24.81 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  25.97 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  27.1 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  27.01 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  32.37 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  25.19 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  24.81 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  28.24 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  25.9 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  29.96 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  28.57 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  29.28 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  32.04 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  27.69 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  27.07 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  28.41 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  24.81 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  25.48 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>