More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2532 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2532  putative peptide chain release factor  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3409  class I peptide chain release factor  56.25 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.065669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3493  Class I peptide chain release factor  55.21 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.587503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3473  class I peptide chain release factor  52.63 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal  0.0864622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0971  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  49.53 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2540  class I peptide chain release factor  49.5 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2179  Class I peptide chain release factor  46.67 
 
 		 105 aa  95.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3548  class I peptide chain release factor  47.17 
 
 		 109 aa  95.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00527639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2037  Class I peptide chain release factor  45.71 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00166929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3558  Class I peptide chain release factor  55.21 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3508  Class I peptide chain release factor  45.71 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1621  class I peptide chain release factor  46.08 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000216647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.56 
 
 		 377 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 355 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  42.86 
 
 		 360 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  42.68 
 
 		 372 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  37.14 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  45.21 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  45.21 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0723  peptide chain release factor 1  45.21 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.905014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  36.19 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  31.88 
 
 		 381 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  36.19 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  36.19 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  43.84 
 
 		 361 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  45.21 
 
 		 361 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  36.19 
 
 		 360 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 367 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 360 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 367 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 360 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3664  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 360 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  34.51 
 
 		 357 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  48.57 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  45.21 
 
 		 278 aa  67.4  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  40.2 
 
 		 362 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 360 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  41.3 
 
 		 366 aa  67  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  45.21 
 
 		 363 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  39.05 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 360 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0721  peptide chain release factor 1  42.42 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  33.93 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.21 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2123  peptide chain release factor 1  43.04 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000913582  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  38.6 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  31.88 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  40.45 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  41.28 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  40.74 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  42.47 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  40.66 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  40.22 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  36.45 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  35.51 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  40.45 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  38.53 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  45.45 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2212  peptide chain release factor 1  43.04 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.189214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.21 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  49.3 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  36.45 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  44.59 
 
 		 369 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  35.24 
 
 		 360 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  40.45 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1554  peptide chain release factor 1  38.94 
 
 		 359 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.438091  hitchhiker  0.00494588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0775  peptide chain release factor 1  38.1 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04548  peptide chain release factor 1  41.67 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  40.45 
 
 		 354 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1476  peptide chain release factor 2  40.43 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0780074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>