More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0870 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0870  ABC transporter related  100 
 
 		 528 aa  1056    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.865131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0683  ABC transporter related  85.66 
 
 		 502 aa  791    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0416686 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1325  ABC transporter related  43.36 
 
 		 521 aa  375  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  26.01 
 
 		 571 aa  156  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  26.01 
 
 		 571 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  25.82 
 
 		 572 aa  150  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  25.82 
 
 		 572 aa  150  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  25.23 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1465  ABC transporter related  25 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1506  ABC transporter related  25 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00391095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  32.6 
 
 		 732 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  27.42 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  24.51 
 
 		 568 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  28.52 
 
 		 579 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.47 
 
 		 741 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  26.7 
 
 		 739 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 591 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1569  ABC transporter related  25.54 
 
 		 572 aa  120  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.88 
 
 		 577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  25 
 
 		 581 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.12 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.7 
 
 		 578 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  26.79 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.7 
 
 		 578 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  25.4 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  25.81 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.81 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  30.41 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.12 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  28.4 
 
 		 715 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  25.76 
 
 		 586 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0694  ABC transporter related  23.62 
 
 		 572 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  25.76 
 
 		 586 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.76 
 
 		 586 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  26.5 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  39.52 
 
 		 602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  30.17 
 
 		 737 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3747  ABC transporter related  25 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.903721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.87 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.58 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.54 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  26.87 
 
 		 1042 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.88 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  26.37 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 		 724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  28.23 
 
 		 724 aa  111  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  26.45 
 
 		 578 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.77 
 
 		 574 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  32 
 
 		 579 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  26.69 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.59 
 
 		 574 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  24.69 
 
 		 571 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  31.8 
 
 		 734 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.69 
 
 		 571 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.31 
 
 		 578 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.69 
 
 		 571 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.69 
 
 		 571 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.69 
 
 		 571 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.69 
 
 		 571 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  25.84 
 
 		 606 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.87 
 
 		 571 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  24.17 
 
 		 571 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  25.57 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  28.95 
 
 		 721 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  24.01 
 
 		 588 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3369  ABC transporter, ATP-binding protein and permease  24.75 
 
 		 564 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  31.56 
 
 		 731 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  23.16 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  29.82 
 
 		 597 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.84 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  24.29 
 
 		 597 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  35.96 
 
 		 719 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  34.84 
 
 		 726 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  27.34 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.38 
 
 		 1000 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  26.06 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  30.39 
 
 		 1230 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  25.89 
 
 		 593 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  27.04 
 
 		 590 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.65 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  22.63 
 
 		 597 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.56 
 
 		 571 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  33.97 
 
 		 739 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  26.28 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  27.6 
 
 		 595 aa  107  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.15 
 
 		 1040 aa  107  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.18 
 
 		 600 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  28.25 
 
 		 565 aa  106  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.85 
 
 		 726 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  27.05 
 
 		 712 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  38.07 
 
 		 726 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.55 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3407  ABC transporter ATP-binding/permease  24.56 
 
 		 564 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.02 
 
 		 619 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.36 
 
 		 638 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3676  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.56 
 
 		 549 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  32.19 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  25.9 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  37.76 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>