124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1964 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  100 
 
 		 531 aa  1112    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  52.08 
 
 		 524 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  49.72 
 
 		 522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  51.13 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  49.53 
 
 		 517 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  48.88 
 
 		 524 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  48.98 
 
 		 526 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  49.24 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  46.25 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  45.98 
 
 		 525 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  45.98 
 
 		 528 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  46.31 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  45.96 
 
 		 543 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  45.96 
 
 		 543 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  45.6 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  45.6 
 
 		 543 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  44.87 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  43.5 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  42.57 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  42.5 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  41.54 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  46.3 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  45.04 
 
 		 527 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  41.21 
 
 		 524 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  40.75 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  40.93 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  40.37 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  42.04 
 
 		 532 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  40.26 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  38.98 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  38.56 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  40.45 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  39.41 
 
 		 522 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  39.13 
 
 		 507 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  39.17 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  38.76 
 
 		 524 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  37.5 
 
 		 537 aa  332  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.67 
 
 		 507 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  35.47 
 
 		 507 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  36.74 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  37.08 
 
 		 510 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  35.81 
 
 		 515 aa  312  9e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  35.24 
 
 		 501 aa  256  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.95 
 
 		 517 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  36.34 
 
 		 498 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.09 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.44 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  34.02 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.58 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  34.09 
 
 		 497 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  29.83 
 
 		 529 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 507 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.99 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  30.57 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  29.64 
 
 		 529 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  35.49 
 
 		 499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  32.34 
 
 		 497 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  34.33 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  35.29 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  34.89 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.32 
 
 		 492 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.9 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 500 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 503 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  32.3 
 
 		 523 aa  213  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  33.06 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 503 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  32.77 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  29.8 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  29.8 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  33.13 
 
 		 504 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  32.8 
 
 		 506 aa  211  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  34.64 
 
 		 498 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.73 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.44 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  30.86 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.79 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  30.43 
 
 		 538 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.45 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  33.49 
 
 		 503 aa  203  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  31.7 
 
 		 504 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  31.02 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  32.92 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  30.1 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  32.07 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  30.8 
 
 		 538 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.52 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  29.61 
 
 		 500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  29.58 
 
 		 501 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  30.87 
 
 		 501 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>